Si accede alla configurazione dal menu: "Configurazione" -> "Allegato IIIb". Si apre la finestra di configurazione (parzialmente compilata) qui riprodotta:

A sinistra sono elencati i 18 rischi e i 2 accertamenti richiesti dall'allegato IIIb, a destra sono mostrate le corrispondenti voci di MeLaNET. Si noti che:
Le associazioni si modificano con un click sulla lente di ingrandimento o con un doppio click sulla riga. Si passa alla maschera che elenca i possibili rischi/esami da associare alla voce selezionata. Ad esempio un click sulla riga relativa ai videoterminali porta a:

La maschera elenca i soli rischi/esami effettivamente utilizzati nelle cartelle sanitarie, cioè quelli associati ad almeno una persona o un'area funzionale. Inoltre, per facilitare ulteriormente le operazioni, propone solo gli elementi che non siano già stati associati ad altre voci.
Si raccomanda di definire completamente la configurazione, prestando la massima attenzione anche in base all'uso fatto delle varie voci di rischio, prima di generare i dati relativi agli allegati. Infatti l'attendibilità dei valori generati dal sistema dipende strettamente dalla configurazione impostata.